乌斯塔沙当时信奉纳粹的意识形态。他们的目标是建立一个种族上的“纯”克罗地亚，并且视生活在克罗地亚与波黑的塞尔维亚人为他们的主要障碍。这样，1941年5月，乌斯塔沙政府部长米勒·布达克、米尔柯·普克、密洛凡·詹尼茨等人宣布了乌斯塔沙的目标：在克罗地亚独立国境内，三分之一的塞尔维亚人必须改信天主教； 　　在克罗地亚独立国境内，三分之一的塞尔维亚人必须被驱逐出境；
　　在克罗地亚独立国境内，三分之一的塞尔维亚人必须被彻底消灭。
　　纳粹意识形态同时也带来的一个小问题：克罗地亚人本身是斯拉夫人，这样按照纳粹的标准，他们自己反而成了劣等种族。为此，乌斯塔沙的理论家们不得不编造一套理论用来证明克罗地亚人起源于“非哥特文化”，从而使自己步入雅利安人的行列。

　乌斯塔沙领导层的家庭成员中有犹太血统或塞尔维亚血统的，会被授予“荣誉雅利亚人”的头衔。但是，一些低级别的乌斯塔沙分子不得不依靠杀害自己的塞尔维亚妻子或孩子来证明自己的忠诚。
　　乌斯塔沙把斯拉夫穆斯林看成穆斯林克罗地亚人。和塞尔维亚东正教徒不同的是，穆斯林并不受迫害。他们有的参加了乌斯塔沙的克罗地亚国防军，有的参加了乌斯塔沙的种族清洗活动，甚至还有的参加了纳粹德国党卫军，组成了党卫军第13“圣刀”志愿山地师（克罗地亚第一师）和党卫军第23“短剑”志愿山地师（克罗地亚第二师）。乌斯塔沙政府甚至把萨格勒布的一座前博物馆改建为清真寺。除此之外，乌斯塔沙反对工业化和民主化。

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